刺客教條1故事是在歐洲中古時期，統治者以高壓方式統治人民誅殺異己，百姓苦不堪言。一位白衣刺客阿泰爾，以來無影去無踪的高超殺人技巧，專門暗殺貪官污吏，而成為信守刺客教條的刺客。刺客教條1可以自由的在各大城市中穿梭且有其他附加任務可以做，場景非常龐大，而且畫面效果一流。刺殺之前還會有專門的調查階段，可從各處的之高點利用新穎的獵鷹視角模式調查附近情況。之後調查偷聽訊息，逼問獲得訊息，偷竊訊。達到一定程度後可取得羽毛接著就去刺殺目標了。
在一片藍白迷霧之中，Desmond 邁爾斯(Miles)（本作主角的實體）彷彿聽到有人不停地指示他做出一些動作，然而做出這些推、打、走、跑動作的角色卻是一名被稱為阿泰爾(Altair)（遊戲中的發音是”阿塔伊爾”）的白斗篷男，玩家在這個階段可以控制阿泰爾(Altair)，不過還不算正式的遊戲導覽，所以無論你怎麼做，最後整個畫面都會白掉
「我沒辦法把他記憶尋址！他有太多的精神創傷….」露西·斯蒂爾曼(Lucy Stillman)著急地說。
「Stillman，你重試一次，先別窮緊張….」沃倫·韋迪克(Warren Vidic)博士指示道，他湊近仍未清醒的邁爾斯(Miles)，低聲耳語，「注意聽我的聲音，記得你所看見的一切，那都不是真的，它們只是過往時空的片段而已，傷不了你的」（#*＠！$#&*，迷霧中的阿泰爾(Altair)被飽以老拳，痛得趴在地上）
「我們快要失去他了！必須把他拉出來！快，就是現在！」露西·斯蒂爾曼(Lucy Stillman)十分堅持。
「哎，好吧！」沃倫·韋迪克(Warren Vidic)博士不怎麼情願中止實驗，但也只好輕輕說了一句「我們要帶你出來了－－」
Desmond 邁爾斯(Miles)躺在這台可以感應記憶的成像器－－Animus上，沃倫·韋迪克(Warren Vidic)博士和他的助理露西·斯蒂爾曼(Lucy Stillman)急忙調整Animus，因為主角邁爾斯(Miles)的大腦產生激烈的抗拒反應，似乎在一場永遠不會醒來的惡夢裡掙扎著。突然間，一切吵雜聲都停止了，邁爾斯(Miles)回到了現實－－
「我就說他會沒事的」沃倫·韋迪克(Warren Vidic)博士輕描淡寫地說。
「啊～～～＃他ｘｘ的混蛋！」邁爾斯(Miles)被嚇醒從感應記憶成像器上跳了起來。
沃倫·韋迪克(Warren Vidic)：「餵－，我剛剛才救了你一命…」
邁爾斯(Miles)（暴怒）：「救我！？你們是綁架我吧！還把我架在這個…這個不知道什麼碗糕上！」
沃倫·韋迪克(Warren Vidic)：「它叫Animus」
邁爾斯(Miles)：「我根本不認識你們…，為什麼你們要對我做這種事？」
沃倫·韋迪克(Warren Vidic)（冷笑）：「因為你有我們需要的…情報，邁爾斯(Miles)先生」
邁爾斯(Miles)（哭笑不得）：「情報？！老天啊－－我只是個酒保，你要我做什麼？教你怎麼調馬丁尼嗎？」
沃倫·韋迪克(Warren Vidic)：「我們知道你是誰，你的身份…」
邁爾斯(Miles)（小嚇到，撇過頭去）：「我…我不知道你在說什麼…」
沃倫·韋迪克(Warren Vidic)：「不要對我裝蒜，在過去的某個時空裡，你曾是一名刺客，不論你有沒有自覺，總之，我的老闆需要從你封印的記憶裡找到一段重要的情報。」
邁爾斯(Miles)（反駁）：「但我才不是什麼刺客…再也不是了。」
沃倫·韋迪克(Warren Vidic)：「嗯嗯－－我們調查過你的背景，是這麼說沒錯…，還在跑路呢！這點對我們來說可省了不少力氣。」
邁爾斯(Miles)（無奈）：「那…你們到底要我怎麼樣？」
沃倫·韋迪克(Warren Vidic)：「很簡單，我們叫你做什麼，你就照辦，如此一來，這台Animus就可以幫我們從你的記憶片段中找到我們要的情報。一旦重要情報被找到後－－，你就自由了！」
邁爾斯(Miles)（生氣）：「我絕對不到再回到那裡去了！」
沃倫·韋迪克(Warren Vidic)：「如果你不肯聽話，那我們只好來硬的，強制讓你進入昏迷狀態，我們一樣可以繼續找我們要的情報，不過等我們找到後，就沒人會管你死活了。」
沃倫·韋迪克(Warren Vidic)的話讓助理露西·斯蒂爾曼(Lucy Stillman)打了一個寒顫。
由於情勢比人強，主角邁爾斯(Miles)很無奈地又躺回去，從畫面中我們注意到這個謎之實驗室的空間有幾件有趣的東西，除了主角在躺的這台叫Animus的感應記憶的成像器，還有沃倫·韋迪克(Warren Vidic)博士的的辦公桌上面有一台需要密碼才能進入的筆記型計算機，另外前方有兩個扇門，一道是通往讓邁爾斯(Miles)休息的臥室，一道是監看窗另一側的會議室，右方有個只有研究人員才能通行的大門。雖然邁爾斯(Miles)現在除了乖乖躺下外別無選擇，但後來游戲進行到一個大段落後，會有讓邁爾斯(Miles)在這個空間自由行動的過場，有些重要情報要在這段時間內取得。所以千萬不要一直在Animus長眠不起，記得有空要下來走動走動。
接下來沃倫·韋迪克(Warren Vidic)博士簡單地解說一下Animus的運作方式，他宣稱自己研究人類記憶三十餘年，最突破性的見解就是人們不只有自己本身的記憶，還帶著老祖宗的記憶，這些記憶儲存在個體的DNA序列裡，人類基因組大約由30億單位組成，其中只有3%比對出其生物學上的功能，剩下97%似乎只是漫長演化史中遺留下來的產物，然而那些看似無用的片段，就是沃倫·韋迪克(Warren Vidic)博士認定的記憶數據庫，個體生命中曾發生的重大事件，可以透過遺傳的方式留給後代，這些記憶來得比像鳥類飛行或覓食這一類本能更為細膩，透過Animus不僅可以記憶尋址，還可以讓使用者透過同步感應的方式，直接置身於其祖先的記憶中。
隨後，助理露西·斯蒂爾曼(Lucy Stillman)為Animus解說要找到那段「重要情報」的方式。與其說「重要情報」存在於邁爾斯(Miles)的腦中，不如說「重要情報」其實是在公元1191年刺客阿泰爾(Altair)的記憶裡，而邁爾斯(Miles)並不是阿泰爾(Altair)的唯一現存後代，其實Animus這台感應記憶成像器的初期測試，已經找來一些阿泰爾(Altair)的後代加以「實驗」，很不幸地，他們的不僅沒感應到「重要情報」，最後的下場都很悲慘。也許對其他的受試者來說，苦難已經結束了，可是邁爾斯(Miles)與玩家的厄運才剛要展開。由於邁爾斯(Miles)的意志耐受力很高，所以在與其祖先阿泰爾(Altair)的同步感應上反而造成相斥現象，也就是說，玩家初始的同步感應值（Synch Bar）只有4格，相當於阿泰爾(Altair)的血量（遊戲導覽中的阿泰爾(Altair)會有13格，不過…不必高興太早），如果被扣到0格，就會強制讀檔跳回最近一個儲存點。更慘的是，邁爾斯(Miles)無法直接存取最後的那段「重要情報」，他只能從比較清晰穩定的記憶開始，一點一滴向「重要情報」邁進，所幸，我們玩家並不需要把每個片段補齊才能進入下一階段（就算你都補齊了，到遊戲中期以前，邁爾斯(Miles)對阿泰爾(Altair)經歷的事件仍算跳躍式的記憶，許多事件的來龍去脈仍然很謎）。
另外值得一提的是，由於阿泰爾(Altair)經歷的事件都是邁爾斯(Miles)回憶出來的，所以並不會發生真正的「任務失敗」這種事，記憶中的阿泰爾(Altair)就算失手，邁爾斯(Miles)只要等記憶感應回复穩定，就可以在腦中重現一次阿泰爾(Altair)尚未失手前的景象，讓玩家試到成功為止；所以如果你覺得有些NPC像鬼擋牆一樣，老是說相同的話，做相同的事，站在很類似的地方，或是明明阿泰爾(Altair)才剛刺殺一名NPC守衛，但其它的NPC守衛會很白目地走過來說「什麼？是誰殺了他？有目擊者可以說一下發生什麼事了嗎？」完全不懷疑只不過是低下頭溜出去（Blend，混入人群）的阿泰爾(Altair)，也不必用太執著於真實性…畢竟「Nothing is true」。
另一個要注意的是阿泰爾(Altair)的身份曝露程度（Social Status Icon），通常只是在完成明目張膽的刺殺後，才會陷入較長時間的紅三角（Exposed，身份敗露）狀態，開始會有守衛前來追殺阿泰爾(Altair)，不過沒關係，來一個就殺一個，來兩個殺一雙，這是一個鼓勵玩家多殺守衛（最好還能多多嘗式用不同武器與不同殺法）的遊戲，有一堆成就可以解，只是有些任務在阿泰爾(Altair)是紅三角的狀態是不能回報的，所以平時在大城市裡還是保持低調（白三角，Anonymous）比較好，不要沒事一直推倒路人（注1）。
至於代表特定NPC守衛警戒狀態的是人字型符號（中央有白、黃、紅圈）表示，在阿泰爾(Altair)視角自動注視，或是按LT鎖定目標時可以觀察，其實從NPC的拿武器的狀態就可以看出，通常已經是紅圈拔劍者（該NPC知道有敵人在附近），阿泰爾(Altair)以袖裡劍（十字鍵按上）背刺的成功率就會下降，不過阿泰爾(Altair)仍可以進行跳躍擊殺（RT跑向目標+ X袖裡劍攻擊），帥氣度滿點！
阿泰爾(Altair)身為一代刺客，當然還有許多神乎奇技的格鬥術，這些進階操作技巧，會在後來的遊戲流程中逐一說明（因為角色等級不夠，這些動作也怎麼按也按不出來）。
序幕
所羅門王的聖殿 耶路撒冷（Solomon’s Temple－Jerusalem）
在邁爾斯(Miles)初始記憶裡阿泰爾(Altair)是一個自負到了極點的傢伙
記憶片段1/4
長老阿爾莫林(Al Mualim)派我到所羅門王聖殿下的坑道遺址進行任務，說是有一個重要的古物被聖殿騎士團（the Templars）的人守住，要我把它取回來，可是…，長老有沒搞錯啊？這種找東西拿回來的小差事明明是低階新手的工作，怎麼會叫我來做呢？我阿泰爾(Altair)可是阿薩辛組織裡的頭牌刺客，真不明白長老阿爾莫林(Al Mualim)是怎麼想的，更糟的是，他老人家竟然要我在任務中看顧好馬利克(Malik)和卡達爾(Kadar)這對個小兄弟！ ！真是的，他們最好別妨礙我的工作。
幽暗的坑道裡，一名聖殿騎士團找來重做支架的老工人不知道自己已經大難臨頭。
「等一下！一定還有其它的辦法！我們不需要殺死這個人！」馬利克(Malik)想要阻止阿泰爾(Altair)的行動。
然而阿泰爾(Altair)早已用迅雷不及掩耳的速度給了不幸者致命一擊。
「哇～～真是完美的格殺！幸運之神總是眷顧你的劍刃。」這次行動中職級最低的卡達爾(Kadar)興奮地說。
「這不是靠幸運，而是貨真價實的技巧。乖乖地跟著學，或許有一天你會明白。」阿泰爾(Altair)冷冷地回答。
「沒錯，這個人會教你怎麼把長老訓誡我們的一切都踩在腳下，哼！」馬利克(Malik)相當不爽而反諷一句。
「喲～那你到說說看，你會怎麼進行任務？」阿泰爾(Altair)瞄了馬利克(Malik)。 馬利克(Malik)雖然已經加入阿薩辛組織很多年，表現也相當傑出，在位階上是僅次於阿泰爾(Altair)的高手，但個性上阿泰爾(Altair)就是不喜歡馬利克(Malik)那種瞻前顧後，把人命看得比什麼還重要的樣子，在阿泰爾(Altair)的眼中，奪人性命是刺客的天職，不論是那些罪該萬死的，還是那些所謂的無辜者，並沒有差別，為了達到長老交付的任務，使用任何手段都可以。
「我不會引來不必要的注意，也不會傷害那些無辜的生命，我所做的一切都依循著阿薩辛的信條。」馬利克(Malik)認真地說教了起來。
「『沒有什麼是真實的，任何手段都被允許』。如果你懂這句話，就會明白我們怎麼進行任務都沒關係，重點是把任務完成就對了！」阿泰爾(Altair)抬出長老阿爾莫林(Al Mualim)的另一句訓示想壓倒馬利克(Malik)的說法。
「這不該是我們阿薩辛的做法….」馬利克(Malik)非常不認同阿泰爾(Altair)曲解長老阿爾莫林(Al Mualim)的訓示。
「我的做法更好。」阿泰爾(Altair)的語調更為強硬，並帶著殺氣。
「算了…我先去探路。只要你別再做這些令我們蒙羞的事就好了。」馬利克(Malik)不願再爭辯，阿泰爾(Altair)的眼睛長在頭頂上，有時馬利克(Malik)會覺得或許哪一天連長老阿爾莫林(Al Mualim)也管不住阿泰爾(Altair)了。
馬利克(Malik)一個轉身，就像蜻蜓點水般地跳過了維修中的坑道木架。
卡達爾(Kadar)看哥哥馬利克(Malik)不太爽地離開，想說說話來緩和一下氣氛，因為他相當崇拜阿泰爾(Altair)。 卡達爾(Kadar)問了這次的任務目標是什麼，顯然連阿泰爾(Altair)自己也不清楚，只知道長老阿爾莫林(Al Mualim)認為聖殿騎士從所羅門王聖殿找出的這件古件非常重要，為了確保取回過程萬無一失才派出愛將阿泰爾(Altair)。
接下來的坑道是單一路徑，照指示按移動左模擬前進，押RT + A加速起跳，就通過了維修中的坑道木架，上爬上樓梯後會遇到第一可以用袖裡劍背刺的敵人，不管是否是用LT鎖定，只是小小走過去，X自動會在最近距離變為「刺殺」（assassination），如果想試炫技的「跳躍擊殺」（HIGH PROFILE Kill：RT跑向目標+ X袖裡劍攻擊）也行。
進入目標區（Objective，地圖上是個箭號）所在的室內，又會再觸發一段有乾擾現象的過場（有2次）。
「這想必就是傳說中的『約櫃』(the Ark)了！」馬利克(Malik)指著目標區那個金光閃閃的大箱子。不過他們的目標是約櫃上面像聖杯狀的古物。
「是…『誓約之櫃』(Ark of the Covenant)？」卡達爾(Kadar)十分吃驚。
馬利克(Malik)對於刺殺技巧以外的知識比自己懂得多，阿泰爾(Altair)一直都不太願意承認這點，不過對於「約櫃」的傳說，阿泰爾(Altair)是多少知道一些。先知摩西拿到上帝給的十誡之後，把十誡石板就存放在約櫃裡，猶太人出埃及之後，約櫃就隨著他們一起流浪，後來據說被所羅門王給供奉起來，存放在聖殿裡。不過阿泰爾(Altair)向來是個懷疑論者。
「世上根本沒有這種東西，那不過是個傳說罷了！」阿泰爾(Altair)並不認為約櫃存在，或者說，在他們眼前即將入手的古物和約櫃沒什麼關係。
「那麼…那個金箱子是什東西？」卡達爾(Kadar)問道。
阿泰爾(Altair)正答不出來時，剛好有人從下方坑道走出來，馬利克(Malik)示意噤聲，原來是聖殿騎士團領袖羅伯特·福克納(Robert de Sable)帶著幾名隨從入內視察，他命人加快重建聖殿的防禦工事，好儘早把寶貴時間用來對付盤據在馬西亞夫（Masyaf）的阿薩辛組織。
「羅伯特·福克納(Robert de Sable)！他的人頭我拿定了！」阿泰爾(Altair)握著劍柄，露出獵鷹般的眼神。
「不！我們的任務只是要取回古物而已，長老特別交代，若非必要就不需和羅伯特(Robert)正面衝突」馬利克(Malik)再次擺出一副安全第一的樣子，惹毛了阿泰爾(Altair)。
「羅伯特(Robert)擋在我們和古物中間，除去他是必要的。」阿泰爾(Altair)強調。
「但小心行事…」
「你是指用膽小鬼的方法嗎？」阿泰爾(Altair)不等馬利克(Malik)把話說完，「那個人是我們阿薩辛最大的敵人，現在怎麼能放過一口氣把他料理掉的機會？」
「阿泰爾(Altair)你今天已經犯了我們的兩大信條，現在難道還想要連第三信條『絕不危及同盟兄弟的安全』都拋諸腦後嗎？」馬利克(Malik)嘆口氣道。
「我說的你照做就是了，我的等級比你高，不論是位階還是實力！你最好不要質疑的我命令！」阿泰爾(Altair)拿出這種話來壓馬利克(Malik)，這已經是他最後的手段。
如果知道不羅伯特·福克納(Robert de Sable)是哪一隻的話，控制阿泰爾(Altair)爬樓梯下來之前，可以先按Y用鷹眼視覺看一下，亮黃色光芒的就是羅伯特(Robert)。等阿泰爾(Altair)大剌剌地走近羅伯特(Robert)一干人等時，各位可能和筆者有同樣的疑問－－這傢伙真的是刺客嗎(-_-|||)？
「原來是阿薩辛的小丑們…，難怪有些守衛無緣無故地消失了。你們有何貴幹？」羅伯特(Robert)對這些不速之客並不感到意外或有絲毫地恐懼。 （按LT鎖定高大的羅伯特(Robert)後，押X觸發刺殺過場）
「你的鮮血！」阿泰爾(Altair)一個箭步起身沖向羅伯特(Robert)。
「不要－－」但就在同時，一旁的馬利克(Malik)竟然伸手攔住阿泰爾(Altair)的攻勢，雖然沒有擋下，但轉瞬間的誤差已經讓羅伯特(Robert)搶到防禦的先機。
「阿薩辛的小丑，你完全不知道自己在幹的是什麼事，」羅伯特(Robert)左手架住阿泰爾(Altair)的袖裡劍，右手掐住他的脖子，阿泰爾(Altair)完全處於下風，羅伯特(Robert)用力一扭把阿泰爾(Altair)轉向正在維修中的信道口，「我饒你一命的目的是讓你帶話回去給你們的長老，聖地早就不屬於你們的了，他有自知之明的話最好趁早逃命去，若想留下的，滅毀是你們必然的命運！」
羅伯特(Robert)使勁一推，阿泰爾(Altair)撞開信道口支架摔了出去，聖殿遺蹟的石塊也崩了下來，把阿泰爾(Altair)和馬利克(Malik)及卡達爾(Kadar)分隔開來。雖然想要去救他們，可是原本的信道口無論如何也回不去了，加上阿泰爾(Altair)聽見羅伯特(Robert)下的格殺令與卡達爾(Kadar)的慘叫聲，他心頭一沉，知道他們兩人兇多吉少，現在是自己逃命要緊（筆者註：我真是越來越瞧不起這傢伙了）。逃出所羅門王聖殿的路徑很單純，照地圖右上角的箭號一路爬跳就過了，如果你還不太習慣阿泰爾(Altair)的體術技巧，最好在這裡多練一下，因為之後遊戲流程裡的「調查階段」會需要阿泰爾(Altair)在許多建築物間跳來跳去。
