序列零.記憶01.德莫萊的悲劇
1307年10月13日 巴黎
玩家所扮演的你進入到遊戲當中會有12個遊戲供玩家選擇，而唯有左上角第一個「雅克·德莫萊的悲劇」沒有上鎖，所以一開始只能選擇它來開展遊戲。
時間是巴黎1307年10月13日的深夜，聖殿騎士團聖殿騎士團的最後英雄雅克·德莫萊曾經是一位典範，充滿智慧的他卻遭到自己所信任的人，法國國王所背叛。一名紅披肩長官帶著菲利普國王的信函前來拜訪的德莫萊，在要塞之外的騎士與守衛發生了一段不愉快的交談，滿嘴晦氣的士兵放行後卻埋伏門外已久的敵人一瞬間就突破了毫無防備的守衛陣線，騎士團駐地瞬間陷入戰火之中。團長雅克·德莫萊當然立刻明白了事態，立刻指揮部下組織防禦，但是卻對身旁的騎士交付了不同的任務。
德莫萊拉深知被出賣了，雅克明白這次入侵跟刺客組織脫離不了乾系。他認為刺客組織的核心思想無非是無政府主義妄想，而且影響非常難以根除。便要求其他士兵抵抗，危難關頭，他託付給了身旁的騎士任務，去塔樓取回劍和聖書，並且將他們藏起來，然後帶走一名騎士團士兵。
劇情之後我們獲得了人物的控制權，操控這名聖殿騎士的士兵跟著德莫萊團長前進，兩人發現入侵的並不止菲利普國王的士兵而且還有刺客協助他們，現在需要立即趕往塔樓。 WASD移動人物，鼠標調整攝像頭位置，按E來格擋敵人的攻擊，鼠標左鍵攻擊敵人。
照理來說，刺客應該是在幾十年前（1307年之前）就被蒙古的可汗摧毀掉才對，而德莫萊認為刺客就像瘟疫，不容易根除。
進入到戰區，沿途的敵人可以躲過不用打，一直朝著塔樓方向跑去即可，不過我們到達塔樓前，發現有人升起了前往塔樓的吊橋，要塞城門已經關上了，別無他法只能尋找別的通道。
隨後聖殿騎士團團長德莫萊命這名士兵上到塔樓拿取聖劍和聖書，然後將它們藏起來。
沿著梯子爬上去之後按空格鍵可以攀爬牆壁，一直按住空格可以往上爬，按E則是往下，然後往塔樓的窗戶爬上去並進入到室內，穿過室內從另一側的窗戶外出，接著從露台跳到旁邊的牆上，繼而轉移回到之前露台上方的窗戶一直往上爬，最終進入到上方露台，那兒有一間冒煙的房間。
在我們到達塔樓頂部的時候一陣煙幕彈阻礙了我們的視線，隱約能夠看到一個人影往裡面走去。沿著冒煙的房間的走廊往下層走去，會看見一名被刺傷的同僚，，卻發現聖書跟劍都已經被一個兜帽人奪走，必須追上他。跟隨刺客逃走的路線我們從窗口一躍而出，這樣高距離的下墜並不會造成傷害。抓住了對面的牆壁之後發現刺客也從乾草車裡鑽了出來，仇人見面分外眼紅，自然是緊緊咬住。
跟隨著刺客奔跑，沿路會遇到一些障礙物，可以在奔跑時按一下E鍵可以不減速的狀態下翻過障礙物。落到城牆下方，眼前就要追上刺客了，刺客會投擲出一顆煙霧彈，蒙蔽了視線，往前繼續尋找刺客的行踪時，卻被他撲了出來，好在危急時刻格擋開了袖劍的致命一擊，我們迅速的扭開了刺客開始正面交鋒。 。
按E鍵格擋，按鼠標左鍵攻擊，基本按照防守反擊的套路就可以擊退他。但黑衣刺客的血量非常高，所以不可能一次性就把他擊倒，纏鬥一陣之後刺客會丟一個閃光彈甩開我們，繼續往前追。
隨後黑衣刺客會逃跑一段路，只需跑幾步又可以追上他，再次追上刺客時的戰鬥刺客的攻擊需要我們按空格鍵來閃避重擊，閃避+攻擊合理運用，能順利的解決掉刺客。但這次黑衣刺客再也沒有僥倖，這名士兵撿起地上的聖劍指向黑衣刺客，頓然一道形似閃電的金色強光射向了黑衣刺客，黑衣刺客失去了意識便倒地。
解決了刺客之後，這名士兵奪回了聖書和聖劍，然後就將它們帶到了秘密石室安放。當他安放好兩件聖物走出石室之際，卻看到了令他絕望的一幕。戰鬥已經結束，雅克團長也被俘虜了。看著這一幕，騎士的眼中充滿了絕望。在這時候突然出現的刺客，利落的解決了騎士的性命，兩件聖物亦落入到刺客的手中。
七年後，克萊門教皇以及法國國王菲利普經過審訊後決定將德莫萊和一名聖殿騎士團成員被束縛在火架台上進行火刑處死。深深覺悟的雅克看著剛愎自用的國王跟教皇，不服判決的德莫萊口出狂言，並詛咒菲利普國王之後十三代的人都不得好死，用自己生命最後的時間完成了最惡毒的詛咒。
最終菲利普國王等人都只是目不轉睛、靜靜地看著德莫萊以及另一名聖殿騎士團成員被活生生燒死，高貴的雅克的死亡，至此象徵著真知的時代化為泡沫消逝。
（歷史背景：德·莫萊臨死前在火堆前大喊，給腓力四世和克萊蒙五世施下詛咒。當時現場的隨從說，“德·莫萊警告教皇和腓力四世，在一年內的某一天，教皇和腓力四世必須在上帝面前承認他們的罪行。”事實也正如此，在德·莫萊死後不到一年的時間裡，克萊蒙五世以及腓力四世都相繼去世。）
從過去的回憶之中醒來之後，我們眼前出現了一個不認識的女人，她做了一番自我介紹，並自稱是主教，而且剛才的一幕是Abstergo挾持了主角的神經元才發生的，她連同一名叫作迪肯的人力勸”你“加入到刺客組織，而他們自然是反抗組織，來阻止Abstergo通過控制歷史來達成可怕的目的。主教告訴你其實Abstergo公司一直在利用像”你“這樣有著刺客血統的人，他們正在挾持”你“的神經元，透過遺傳因子的記憶幫助他們攫取歷史數據。想Abstergo這種大財團，他們控制了許多相關企業、政府機構、媒體業界還有非政府組織，為的就是要掌控歷史。
現在刺客組織需要你，然後主教強行對”你“載入基因序列AD16-B13-187，她還告訴”你“，上週他們去的了Abstergo helix尚未定序的記憶資料庫，她可以向你提供小部分樣本，讓”你“明白到對抗Abstergo的意義。將主角的資料導入到數據庫之後，她邀請我們再一次回到過去。
