《英雄傳說2》第三章《龍之卵》將故事推向更深層次的神秘與緊張。當亞德蘭斯與他的夥伴們抵達拉奴拉王國，準備參加一年一度的龍之祭典時，卻發現原本神聖的龍之卵突然放射出不祥的紅光。這一異象預示著世界將迎來巨大的危機，而亞德蘭斯必須立刻展開行動，揭開龍之卵異變的真相。隨著調查深入，他們將面臨前所未有的挑戰，並逐步接近隱藏在世界背後的更大威脅。
路迪亞城
「大盜賊蓋伊」在說明了事情的來龍去脈後，突然接到士兵的緊急報告，稱魔怪的數量開始急劇增加！於是，「蓋伊」決定獨自前往尋找「奈雷」隊長，試圖獲取一些有關這突變的情報。另一方面，「芙蘿拉」因為要繼續在拉努拉王國尋找「芙蕾依雅」女神，在「藍特」的護送下先行離開。而「亞德蘭斯」和「辛蒂」則決定前往依修村，繼續他們的旅程。
這段時間，地上世界的怪物變得異常強大，加上隊伍中只有亞德蘭斯和辛蒂兩人，建議先專注於推進劇情，稍後再回來挑戰怪物。如果你想掛機練等的話，我建議前往地下世界的丘伯拉門口附近，那裡的怪物不算強，而且容易遇敵，是個不錯的練等點。
另外，拉法要塞的咒文店現在開始販售強力的古代裝備。值得一提的是，這些防具曾經是一代遊戲中的最終裝備，但在二代中卻變成了中途就能獲得的物品，讓人感覺有點惆悵。
伊秀塔村
當他們來到伊秀塔村，在地下密室內找到「利德」，首領利德對王子表示感謝，感謝他成功救出了自己的父親。向他詢問有關對付魔物以及龍蛋的對策。然而，「利德」表示他也無計可施，對此束手無策，並坦言他從未聽說過關於龍蛋的事情。這時，一位村民提到在伊豆看到了王子的兩位同伴。
伊豆
在鎮長家的前方遇到「藍特」和「芙蘿拉」，他們剛從「芭芭拉」祭司那裡得知，怪獸的出現與「芙蕾依雅」女神之間似乎有著某種聯繫。為了弄清楚詳情，建議前往尤頓聖域找「芭芭拉」探詢事情的真相。
約爾德港
沿著右上方的通道一路前行，最終來到聖域，並找到了「芭芭拉」祭司。她告訴你，龍蛋是唯一能夠直接與「芙蕾依雅」女神進行溝通的地方。為了進入龍蛋，她將必要的物品《龍之淚》交給你。
隨後，離開港口，沿著下方的路徑前行，最終來到塞利斯城廢墟旁的龍蛋內。
塞利斯城廢墟龍蛋
進入地上世界的任何一個發出紅光的龍蛋後，走到最深處並調查那裡的奇妙機械。要進入龍蛋，必須從正中央進入，而進入後深處的大型建築也需要從正中央靠近才能進入。如果覺得路上的怪物太多，你可以將移動速度設置為「慢」，這樣怪物的移動速度也會變得較慢。
具體位置包括：原克魯斯村附近（從路迪亞傳送過去）、麥克尼爾島（位於拉法要塞西北的島上，從拉法要塞傳送過去，靠近一代的古恩之塔）、以及原馬斯昆附近（同樣從拉法要塞傳送過去）。
伊豆
前往鎮長「大盜賊蓋伊」那裡，他透露從「奈雷」隊長處得知，怪獸不斷出現的原因與地底人有關。地底人的國度中，會選出一位擁有各種知識的皇帝，據說其中甚至有人能製造怪獸。然而，由於某種原因，這位皇帝的權力被奪走，並被囚禁在奇貝城的普洛斯收容所裡。
認為怪獸持續出現的原因一定與皇帝有關，於是大家決定先去找反抗軍組織打探更多的情報。
伊秀塔村
在地下密室見到「里達」後，他透露反抗軍已找到一條通往奇貝城的地下捷徑。只要先渡過撒皮亞湖，再穿過一座塔，便能抵達奇貝城。
沙皮亞湖
渡過湖泊後，繼續前行。途中會經過一座名為伊豆生命之塔的建築，外觀與安奈斯之塔相似。當你打開塔門後，拉奴拉王國內的怪物便消失了。接下來穿越雪原地帶的單線道路，最後抵達「丘伯拉～普洛斯」通道。
丘伯拉
位於村子西南角的隱蔽小路處，走進去是反抗軍的隱藏據點。與隱藏據點內的男子交談後，他告訴你，普洛斯收容所位於城內西南方向。
在左下方通道的男子見你持有戰士之笛，便放行讓你進入密室。
進入密室後，右上方的男子告訴你，反抗軍組織專用的捷徑曾由頑固的老伯「莫凱」挖掘。但由於「莫凱」不再願意與反抗組織有所牽連，他已經停止挖掘地道，並與他的徒弟搬到了尤依希城附近。隨後，從南方出入口離開，經過「丘伯拉～普洛斯」通道，前往普洛斯收容所。
普洛斯
門口的守衛根本不理會人，因此無法進入，只好去找摩根協助。
摩根之家
摩根之家位於「丘伯拉～城」通路的最底端，距離尤希斯非常近。根據劇情，此時前往尤希斯並非必要。如果不小心走到了尤希斯，則應該沿著南方出來，然後在第一個分岔口右轉，接著不斷往東北方向行進，就能抵達摩根之家。
和摩根交談，請「摩根」再次挖掘地道，但他堅決拒絕。和弟子沙米交談，從「沙米」口中得知，原來「摩根」不再挖地道是因為他對過去的愧疚。當初「摩根」挖掘地道時，導致「沙米」的雙親被警衛逮捕，因此他感到深深的愧疚，決定停止挖掘。
再和摩根交談，再次拜託「摩根」時，「沙米」了解了眾人的來意後，決定親自協助「亞德蘭斯」等人。
普洛斯
「沙米」的挖地道技術有限，無法成功打通通道。這時，「莫凱」見狀，決定親自前來協助「沙米」完成地道的挖掘。
經過地道來到收容所的左側牆外，聽到裡面「弗拉」正在勸說兩位老人協助皇帝，但他們卻拒絕了。
「弗拉」離開後，一行人打倒了門口的警衛，成功進入了牢房。「辛蒂」用一拳打破牢門，救出了兩位老者。從他們那裡得知，與他們有相同特殊地位的人總共有五位，每人負責不同的職責。其中一位是「約書亞長老」，專門負責約書亞城的人工衛星，另一位是「史特拉城長老」，負責傳授歷史。而製造怪獸的則是「芙蕾依雅」的長官底下的一名弟子，名叫「弗拉」。
向「約書亞長老」詢問後，得知了關閉龍蛋內部儀器的方法。此時，「依西亞」也來到現場，表示她將護送這兩位長老，並催促眾人儘快前往關閉龍蛋。
庫魯村廢墟龍蛋
從魯迪亞城的上方出口出城，向右行進，來到庫魯村廢墟旁的紅色龍蛋內。進入祭壇後關閉儀器，這樣魔物就不會再繼續生長，而龍蛋也會恢復成藍白色。
馬斯昆城廢墟龍蛋
從拉魯港出發，向左下方前進，經過橋樑後，來到馬斯昆城廢墟旁的紅色龍蛋內。進入祭壇後，關閉儀器，魔物就不會再繼續生長，而龍蛋也會恢復成藍白色。
拉魯港西方龍蛋
從拉魯港出發，沿著海岸向左上方前進，經過橋樑後，到達上方的紅色龍蛋內。進入祭壇後，你會看到魔物「賈諾亞」把守著儀器。
賈諾亞的戰鬥策略
賈諾亞擁有強力的火焰咒，其攻擊能對全體造成超過250HP的傷害。此外，他還會使用死亡咒，這使得戰鬥變得相當艱難。建議在開場時先進行增益魔法，然後立刻施放沉默咒，以防止賈諾亞使用強力技能。隨後，全體成員應集中進行物理攻擊。
如果賈諾亞發動全體火焰攻擊，應該立即使用全體恢復的香菇（在伊豆有售，每個3000金），以維持隊伍的生命值。
若戰鬥過程中仍然感到困難，可以前往拉法要塞購買最新出售的裝備，以提升戰鬥能力。
消滅「加諾」後，你將獲得《杖碎片》。關閉儀器後，所有的龍蛋都會恢復原狀，魔物也將不再繼續生長。
